2029, yakın gelecek Japonya. Tamamen sibernetik bedene sahip Motoko Kusanagi, yeni tehditlere karşı bir önleyici saldırı ekibi kurmak ister. Daisuke Aramaki tarafından Kamu Güvenliği 9. Bölge'ye, nam-ı diğer "Kabuk Timi"ne alınır. Uluslararası bir komplo, "Kuklacı" olarak bilinen bir hacker'a işaret eder. Kusanagi'yi nasıl bir kader bekliyor? Hacker'ın amacı ne? Siberpunk aksiyonda dönemi başlar!