Ninja'lar gizlice kötülüğü kovarlar. Yakuzalar kimsesiz dışlanmışları toplayıp suç işlerler. Yüzyıllar önce başlayan kinleri günümüzde yeniden alevlenir. Ninja Shinoha, iş adamı görünüşlü bir yakuza olan Kiwami ile tanışır. Birbirlerinin kimliklerinden habersiz, anime sayesinde yakınlaşırlar, ancak ninja ve yakuza arasındaki savaş şiddetlenir. Kim hayatta kalacak, kim ölecek, ninja mı yakuza mı?